Présentation du logiciel Anagène

Le menu [Fichier] comprend les options classiques de gestion de fichiers, à savoir l’accès aux banques de données du
logiciel (séquences, programmes et documents), la création, l’ouverture, l’importation,
l’enregistrement, l’impression de fichiers de séquences, et la possibilité de quitter le logiciel.

Le menu [Edition] permet d’accéder aux commandes présentes dans la plupart des logiciels d’édition ou de traitement de texte, à savoir les commandes liées au presse-papiers de Windows (Couper, Copier, Coller), les commandes d’effacement, de sélection, de recherche, d’inversion et de tri de séquences.
Certaines de ces commandes ne sont applicables aux séquences que si la commande Protéger les données du menu Options n’est plus cochée. En effet, au lancement du logiciel, les séquences chargées dans la fenêtre
d’édition sont par défaut ainsi protégées.

Le menu [Traiter] contient les commandes assurant les trois grands types de traitements qu’il est possible d’effectuer
sur les séquences, à savoir :

• les conversions de séquences nucléiques en séquences peptidiques et inversement pour les séquences peptidiques l’affichage des différents codons possibles ;
• les comparaisons de séquences qu’elles soient simples ou par alignement mettant en évidence les discontinuités ;
• l’action d’enzymes de restriction sur des séquences d’ADN ;
• le graphique de ressemblance représente un quatrième traitement à venir et qui sera disponible à partir de la version 2.

Le menu [Options] permet de déprotéger les séquences et d’en autoriser la modification, de définir le type de curseur (simple ou grand curseur) et de règle graduée (en caractères ou en triplets) utilisés, d’afficher ou non les bulles d’aide.

Le menu [Fenêtre] comprend les options propres à Windows, à savoir les commandes d’organisation des fenêtres et des icônes. La liste des fenêtres-filles présentes dans la fenêtre mère d’Anagène y est aussi accessible.

Le menu [Aide] contient la commande A propos d’Anagène qui renseigne sur la version du logiciel et sur son édition.
L’aide en ligne accessible avec la touche de fonction F1 est aussi disponible dans ce menu. Si Anagène fonctionne sur un micro-ordinateur connecté à Internet, des informations et données complémentaires disponibles sur les sites Internet du CNDP et de l’INRP peuvent être consultées dans un navigateur et téléchargées. Un lien mène également vers un site dédié à Anagène. L’accès à ces sites est réalisé à partir de l’option @ Complément en ligne.